Johannes Urs Frahammer wurde 1964 in Freiburg im Breisgau geboren und wuchs in einem katholisch geprägten Elternhaus auf. 1984 machte er Abitur. Nach dem Grundwehrdienst studierte er von 1985 bis 1991 in Freiburg Volkswirtschaftslehre. Ab 1992 war er als Prüfungsassistent, Steuerassistent und ab 1996 als Steuerberater tätig. 2013 wurde bei Frahammer Morbus Parkinson diagnostiziert, fast zehn Jahre später wurde er dadurch berufsunfähig. Frahammer ist gläubiger Katholik, seit sechsundzwanzig Jahren verheiratet und Vater zweier erwachsener Kinder.